Hugo
Mathe-Hubert

Chercheur contractuel
Equipe TrEE
[info]
Tél : -
Adresse : Bâtiment Jean Roget, Domaine de la Merci
Bureau : -
Thèmes de recherche

Je suis un chercheur en Écologie Évolutive spécialisé en Bio-statistique  et Bio-informatique. Je m'intéresse à l'évolution des interactions intra- et inter-spécifique, notamment mutualistes et parasitaires, ainsi qu'à la prédictibilité de l'évolution et aux effets, sur les dynamiques évolutives, des interactions multi-échelles (c-à-d faisant intervenir différents niveaux d'organisation, ex : génome, cellule, organe, individu, famille/groupe, population, communauté, méta-communautés). Pour étudier ces questions, je développe des modèles théoriques, réalise et des évolutions expérimentales et analyse des données de terrain.

Mots-clés

Concepts :
Écologie évolutive, Co-évolution, Évolution multi-niveaux, Endosymbiotes, Parasitoïdes, Phages, Virulence, Paysage adaptatif, Prédictibilité de l’évolution.

Méthodes :
Modèles stochastiques, Évolution expérimentales, Inférences phylogénétiques, Statistiques exploratoires, GLMMs, Statistiques bayésiennes, Apprentissages supervisés, Julia.

Publications

PUBLICATION SCIENTIFIQUE

Ma thèse peut être consultée ici : https://hal.archives-ouvertes.fr/tel-02488934/document

ARTICLES RÉVISÉS PAR DES PAIRS

12 articles publiés, dont 7 en 1er auteur :
    [12] McLean, A. H. C., Hrček, J., Parker, B. J., Mathé-Hubert, H., Kaech, H., Paine, C., & Godfray, H. C. J. (2020). Multiple phenotypes conferred by a single insect symbiont are independent. Proceedings of the Royal Society B, 287(1929), 20200562. [pdf]
    [11] Rat, M., Mathe-Hubert, H., McKechnie, A. E., Sueur, C., & Cunningham, S. J. (2020). Extreme and variable environmental temperatures are linked to reduction of social network cohesiveness in a highly social passerine. Oikos. [pdf]     [10] Mathé-Hubert, H., Kaech, H., Hertaeg, C., Jaenike, J., & Vorburger, C. (2019). Nonrandom associations of maternally transmitted symbionts in insects: The roles of drift versus biased cotransmission and selection. Molecular ecology, 28(24), 5330-5346. [pdf] Cette publication a été le sujet d’une perspective dans Molecular Ecology Perspectives : 10.1111/mec.15295 [pdf]
    [9] Mathé-Hubert, H., Kaech, H., Ganesanandamoorthy, P., & Vorburger, C. (2019). Evolutionary costs and benefits of infection with diverse strains of Spiroplasma in pea aphids. Evolution, 73(7), 1466-1481. [pdf] Cette publication a été le sujet d’un digest dans Evolution : 10.1111/evo.13763 [pdf]
    [8] Mathe-Hubert, H., Kremmer, L., Colinet, D., Gatti, J. L., Van Baaren, J., Delava, E., & Poirie, M. (2019). Variation in the venom of parasitic wasps, drift, or selection? Insights from a multivariate QST analysis. Frontiers in Ecology and Evolution, 7, 156. [pdf]
    [7] Cavigliasso, F.*, Mathé-Hubert, H.*, Kremmer, L., Rebuf, C., Gatti, J. L., Malausa, T., ... & Poirié, M. (2019). Rapid and differential evolution of the venom composition of a parasitoid wasp depending on the host strain. Toxins, 11(11), 629. [pdf] (* : co 1er auteurs)
    [6] Käch, H., Mathé-Hubert, H., Dennis, A. B., & Vorburger, C. (2018). Rapid evolution of symbiont-mediated resistance compromises biological control of aphids by parasitoids. Evolutionary applications, 11(2), 220-230. [pdf]
    [5] Mathé-Hubert, H., Colinet, D., Deleury, E., Belghazi, M., Ravallec, M., Poulain, J., ... & Gatti, JL. (2016). Comparative venomics of Psyttalia lounsburyi and P. concolor, two olive fruit fly parasitoids: A hypothetical role for a GH1 β-glucosidase. Scientific reports, 6, 35873. [pdf]
    [4] Mathé-Hubert, H., Gatti, J. L., Colinet, D., Poirié, M., & Malausa, T. (2015). Statistical analysis of the individual variability of 1D protein profiles as a tool in ecology: an application to parasitoid venom. Molecular Ecology Resources, 15(5), 1120-1132. [pdf]
    [3] Bazin, E., Mathé-Hubert, H., Facon, B., Carlier, J., & Ravigné, V. (2014). The effect of mating system on invasiveness: some genetic load may be advantageous when invading new environments. Biological Invasions, 16(4), 875-886. [pdf]
    [2] Mathé-Hubert, H., Gatti, J. L., Poirié, M., & Malausa, T. (2013). A PCR-based method for estimating parasitism rates in the olive fly parasitoids Psyttalia concolor and P. lounsburyi (Hymenoptera: Braconidae). Biological control, 67(1), 44-50. [pdf]
    [1] Colinet, D., Mathé-Hubert, H., Allemand, R., Gatti, J. L., & Poirié, M. (2013). Variability of venom components in immune suppressive parasitoid wasps: from a phylogenetic to a population approach. Journal of insect physiology, 59(2), 205-212. [pdf]

2 articles en préparation (manuscrits disponibles sur demande) :
    [2] Mathé-Hubert, H., Gatti, J. L., Poirié, M., & Malausa, T. Quantitative genetics of the venom composition of a parasitoid wasp undergoing a host shift. (in prep.)
    [1] Cavigliasso, F., Mathé-Hubert, H., Colinet, D., Gatti, J. L., & Poirié, M. Parasitic success and venom composition evolve upon specialization of parasitoid wasps to different host species. (in prep.) [pdf]

CONGRÈS INTERNATIONAUX

- Communications orales -
    2018 Mathé-Hubert H., Kaech, H., and Vorburger, C. A versatile model of endosymbiosis grounded in multilevel selection and energy flow. Royal Entomological Society: Insect Endosymbiont Special Interest Group. Liverpool, Angleterre. 21-22/03. link
    2017 Mathé-Hubert H., Kaech, H., and Vorburger, C. A model of the evolution of endosymbiosis grounded in cross-level exchanges of energy and information. International Conference on Holobionts. Paris, France. 19-21/04. link
    2013 Mathé-Hubert H., Colinet D, Belghazi M, Thaon M, Gatti JL, Ris N, Malausa T., Poirié M. Variability and evolution of the venom of two biological control agents from the genus Psyttalia. 4th International Symposium on Biological Control of Arthropods. Pucón, Chili. 04-08/03. link
    2012 Mathé-Hubert, H., Colinet, D., Belghazi, M., Thaon, M., Gatti, J. L., Ris, N., Malausa, T., & Poirié, M. Causes of success and failure in biological control: Venom contents and evolution in the parasitoid wasps Psyttalia lounsburyi / P. concolor. 3rdAnnual Meeting of the European PhD Network “Insect Sciences”. Torino Italie. 06-09/11. link
    2011 Mathé-Hubert, H., Colinet, D., Belghazi, M., Thaon, M., Gatti, J. L., Ris, N., Malausa, T., & Poirié, M. Causes of success and failure in biological control: Venom contents and evolution in the parasitoid wasps Psyttalia lounsburyi / P. concolor. 2ndAnnual Meeting of the European PhD Network “Insect Sciences”. Tours, France. 07-11/11. no link

- Posters -
    2019 Mathé-Hubert H., Colinet D., Belghazi M., Thaon M., Gatti J-L., Ris N., Malausa T., Poirié M. How the quantitative genetics toolbox can help evolutionary physiology? A case study of the parasitoid wasp venom. Probabilistic Modeling in Genomics, Aussois, (France), 06-09/10. link
    2017 Mathé-Hubert H., Kaech, H., and Vorburger, C. A model of the evolution of endosymbiosis grounded in cross-level exchanges of energy. European Society of Evolutionary Biology. 20-25/08. link
    2015 Mathé-Hubert H., Colinet D., Belghazi M., Thaon M., Gatti J-L., Ris N., Malausa T., Poirié M. Comparative venomics of two olive fly parasitoid wasps (Psyttalia lounsburyi and P. concolor) uncovers a new potential role for myrosinase. Life in Numbers 2. Wädenswil, Swiss. 01/09. link
    2015 Mathé-Hubert H., Kaech, H., and Vorburger, C. Multilevel selection in defensive endosymbiosis: Interplay between eco-evolutionary process occurring within hosts and between hosts. UK - French joint meeting on Aphids. Paris France. 05-06/11. no link

- Actes des conférences -
    2013 Mathé-Hubert H., Colinet D., Belghazi M., Thaon M., Gatti J-L., Ris N., Malausa T., & Poirié M. Variability and evolution of the venom of two biological control agents from the genus Psyttalia. Proceedings Of The 4th International Symposium On Biological Control Of Arthropods, 06-09/10. link

SÉMINAIRES

- Communications orales -
    2019 Mathé-Hubert H., Kremmer L., Colinet D., Gatti J.-L., Van Baaren J., Delava E., Poirié M. Variation in the venom of parasitic wasps, drift or selection? Insights from a multivariate QST analysis. 41èmesjournées des Entomophagistes. Juan-les-Pins, France. 27-29/05. link
    2016 Mathé-Hubert H., Kaech, H., and Vorburger, C. An individual based model in which demography and selection are based on energetic flows. Life Science PostDoc Day. Zürich, Suisse. 10/02. link
    2016 Mathé-Hubert H., Kaech, H., and Vorburger, C. Spiroplasma diversity in pea aphids. Spiroplasma meeting. Lausanne, Suisse. 19/07. no link
    2015 Mathé-Hubert H., Kaech, H., and Vorburger, C. Multilevel selection in defensive endosymbiosis: Interplay between eco-evolutionary process occurring within hosts and between hosts. Ecomeet seminars, Institut Fédéral Suisse des Sciences et Technologies de l’Eau (Eawag). Dübendorf, Suisse. 04/09. no link
    2013 Mathé-Hubert H., Colinet D., Belghazi M., Thaon M., Gatti J-L., Ris N., Malausa T., Poirié M. Evolution du venin chez un auxiliaire des cultures, Psyttalia lounsburyi, et association entre marqueurs vénomiques et succès parasitaire. Rencontres des Porteurs de Projets SPE. Sophia-Antipolis, France. 02-03/10. link
    2012 Mathé-Hubert H., Colinet D., Belghazi M., Thaon M., Gatti J-L., Ris N., Malausa T., Poirié M. Effets de l’élevage sur un hôte de substitution chez les parasitoïdes Psyttalia lounsburyi et P. concolor utilisés en lutte biologique : une approche de vénomique. Colloque national des Entomophagistes “Entomo2012”. Montpellier, France. 23-25.05. link
    2012 Mathé-Hubert H., Colinet D., Belghazi M., Thaon M., Gatti J-L., Ris N., Malausa T., Poirié M. Effets de l’élevage sur un hôte de substitution chez les parasitoïdes Psyttalia lounsburyi et P. concolor utilisés en lutte biologique : une approche de vénomique. 34èmeréunion du Groupe de Génétique et Biologie des Populations, “Petit pois déridé”. Avignon, France. 28-31/08. link
    2010 Mathé-Hubert H., Colinet D, Belghazi M., Thaon M., Gatti JL, Ris N., Poirié M. Variation intra et interspécifique du venin chez un auxiliaire de lutte biologique. 40ième colloque “Immunité des Invertébrés”. 23-25.05. Montpellier, France. link

- Posters -
    2017 Mathé-Hubert H., Kaech, H., and Vorburger, C. An individual based model in which demography and selection are based on energetic flows. Biology’17. Berne, Suisse. 02-03/02. link
    2016 Mathé-Hubert H., Kaech, H., and Vorburger, C. Conflicts and multilevel selection in endosymbionts. Biology’16. Lausanne, Suisse. 11-12/02. link

COMPÉTENCES
Articles correspondants indiqués entre crochets (cf liste des publications).
Les articles en gras sont les plus importants pour la thématique correspondante.
[*] : Textes et résultats non publiés, cf manuscript de Thèse.

ÉCOLOGIE ÉVOLUTIVE
Biologie de l’invasion [3]
Interférences clonales [3], [10]
Génétique des populations [*]
Évolution des symbioses mutualistes [6], [9], [10]
Évolution des interactions hôtes - parasites [1], [5], [6], [7], [8], [9], [*]
Évolution de la spécialisation et interactions pléïotropiques [9], [12], [*]
Évolution de la coopération [11]

MÉTHODES EXPÉRIMENTALES
Développent de PCRs [2]
qPCRs [9]
Électrophorèses de protéines [4]
Dissections d’insectes [2], [4], [5], [*]
Élevage d’insectes [2], [9], [*]
Microscopie à fluorescence [5]
Évolution expérimentale [6], [7], [*]
Plan d’expériences [2], [4], [6], [7] [9], [*]
Microsatellites [*]

STATISTIQUES
Méthodes de normalisations de données [4]
Inférence de pedigrees [*]
Génétique quantitative [8], [*]
Modèles Linéaires (Généralisés Mixtes) [2], [3], [4] ,[5], [6], [7], [9], [10], [*]
Analyses multivariées [4], [7], [8] ,[*]
Analyses phylogénétiques [9], [10], [12]
Apprentissage automatisé (forêts aléatoires) [10], [11]
Analyses de réseaux [11]
Calcul approximatif bayésien (ABC) [10]
Transcriptomique [5]
Protéomique [1], [5], [7]

MODÉLISATION ET PROGRAMMATION
Modéles stochastiques individus centrées [3], [7]
Modéles stochastiques compartimentaux (calcule probabiliste) [10]
Analyses d’images [4], [*]
Développement d’algorithmes [4], [10]
Languages : R, Julia, LaTeX, Python ( + Ctypes)

LANGAGES
Français (langue maternelle), anglais (courant).