Devant la multiplication des recueils informatisés d’informations médicales structurées, les statisticiens et les épidémiologistes souhaiteraient de plus en plus bénéficier, pour leurs études, du regroupement de fichiers nominatifs provenant de plusieurs sources. Toutefois, le croisement de fichiers, pour le regroupement d’informations relatives à un même patient, requiert le respect des législations française et européenne relatives au traitement des données à caractère personnel. Après avoir fait le point sur ces législations, nous décrivons la procédure d’anonymat et de chaînage des informations rendues anonymes développée par le DIM1 du CHU2 de Dijon. Chaque fichier est rendu anonyme à la source, à l’aide du logiciel Anonymat, qui utilise la méthode du hachage irréversible de l’identité. Le chaînage des informations d’un même patient repose techniquement sur un modèle statistique par mélange de distributions. Nous présentons ensuite des exemples d’application du hachage de l’identité permettant la constitution de bases de données régionales ou nationales. Ces exemples montrent que l’utilisation du logiciel Anonymat permet de relever le défi de la prise en compte des exigences de la CNIL3 sans nuire à la disponibilité des données médicales.