Plateforme de métabolomique par spectrométrie de masse

* Mission de la plateforme
Le laboratoire TIMC dispose d’un accès à un spectromètre de masse haute résolution couplé à une système de chromatographie liquide pour la recherche fondamentale, la recherche translationnelle et clinique en santé, et d’un savoir-faire de l’équipe en analyse de données de métabolomique non ciblée. La plateforme de métabolomique GExiM est une structure technologique hospitalo-universitaire (UGA et CHUGA) fondée en 2018 qui a pour objectif l'étude du métabolome, c'est-à-dire de l'ensemble des métabolites (molécules <1,5 kDa) présents dans un échantillon biologique, pour donner une information diagnostique, pronostique ou thérapeutique ou bien encore d’une meilleur compréhension des mécanismes physiopathologiques des maladies humaines. Elle contribuera à générer des connaissances dans le domaine de la santé, à communiquer aux communautés de scientifiques et au grand public les résultats de la recherche mais aussi à promouvoir la formation des futurs médecins et personnels de santé.
* Localisation :
Plateforme de métabolomique GExiM La plateforme GExiM est localisée à l’institut de Biologie et de Pathologie, facilitant ainsi la prise en charge des échantillons clinique par une équipe pluridisciplinaire compétente constituée entre autres de biologistes des hôpitaux et d’ingénieurs.
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* Équipement :
- Un système de chromatographie : Vanquich Flex Binary W/O Det
- Un spectromètre de masse : Q Exactive Plus avec enhanced resolution mode. System with Ion Max Source, H-ESI II probe, Chemyx Fusion 100 syringe pump and Rheodyne 6-Port Valve.
- Gamme de masse : 50 à 6000 Da
- Résolution de 140,000 à la masse m/z 200 et une vitesse de scan de 1,5 Hz, 17500 la masse m/z 200 à 12 Hz
- Précision de masse : 5 ppm
- Sensibilité : sub femtomole pour des peptides, 500fg de Buspirone « on column,
- Full MS: S/N 100:1 et en mode SIM : 50 fg Buspirone, on column S/N 100:1
- Un générateur d’azote: Nitrogen Generator Genius 1022 (Peak Scientific)
* Personnels :
- Responsables scientifiques : Pr Bertrand Toussaint et Dr Audrey Le Gouellec
- Ingénieurs : Valérie Cunin, Sylvie Michelland et Federica Fiorini
- Comité scientifique : Pr M. Seve (Doyen de la Facuté de Pharmacie), Pr P. Faure (Chef de service de Biochimie, Biologie moléculaire, et Toxicologie Environementale), Dr A.E. Hay de Bettignie (UFR de Lyon)
- Comité de suivi : un coordinateur scientifique, un membre de la DRCI pour le CHUGA, un personnel de Floralis, un personnel de la DGDRIV
* Soutien financier :
Cette plateforme a bénéficié d'une aide de l’État gérée par l'Agence Nationale de la Recherche au titre du programme « Investissements d'avenir» portant la référence ANR-15-IDEX-02.
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* Demande de projet :
