Plateforme de métabolomique par spectrométrie de masse

* Mission de la plateforme

Le laboratoire TIMC dispose d’un accès à un spectromètre de masse haute résolution couplé à une système de chromatographie liquide pour la recherche fondamentale, la recherche translationnelle et clinique en santé, et d’un savoir-faire de l’équipe en analyse de données de métabolomique non ciblée. La plateforme de métabolomique GExiM est une structure technologique hospitalo-universitaire (UGA et CHUGA) fondée en 2018 qui a pour objectif l'étude du métabolome, c'est-à-dire de l'ensemble des métabolites (molécules <1,5 kDa) présents dans un échantillon biologique, pour donner une information diagnostique, pronostique ou thérapeutique ou bien encore d’une meilleur compréhension des mécanismes physiopathologiques des maladies humaines. Elle contribuera à générer des connaissances dans le domaine de la santé, à communiquer aux communautés de scientifiques et au grand public les résultats de la recherche mais aussi à promouvoir la formation des futurs médecins et personnels de santé.
 

* Localisation :

Plateforme de métabolomique GExiM 1er étage Institut de Biologie et de pathologie CHU Grenoble Alpes 9 Boulevard de la Chantourne, 38700 La Tronche La plateforme GExiM est localisée à l’institut de Biologie et de Pathologie, facilitant ainsi la prise en charge des échantillons clinique par une équipe pluridisciplinaire compétente constituée entre autres de biologistes des hôpitaux et d’ingénieurs. 1er étage, pièce N1-215 :  Pre-analytique et analyse de spectrométrie de masse 1er étage, pièce N1-208 :  Post-analytique. Analyses chimiométriques

* Équipement :

• Un système de  chromatographie : Vanquich Flex Binary W/O Det
   
• Un spectromètre de masse : Q Exactive Plus avec enhanced resolution mode. System with Ion Max Source, H-ESI II probe, Chemyx Fusion 100 syringe pump and Rheodyne 6-Port Valve.
  • Gamme de masse : 50 à 6000 Da
  • Résolution de 140,000 à la masse m/z 200 et une vitesse de scan de 1,5 Hz, 17500 la masse m/z 200 à 12 Hz
  • Précision de masse : 5 ppm
  • Sensibilité : sub femtomole pour des peptides, 500fg de Buspirone « on column,
  • Full MS: S/N 100:1 et en mode SIM : 50 fg Buspirone, on column S/N 100:1
     
• Un générateur d’azote: Nitrogen Generator Genius 1022 (Peak Scientific)

* Personnels :

      - Responsables scientifiques : Pr Bertrand Toussaint et Dr Audrey Le Gouellec      

      - Ingénieurs : Valérie Cunin, Sylvie Michelland et Federica Fiorini     

      - Comité scientifique : Pr M. Seve (Doyen de la Facuté de Pharmacie), Pr P. Faure (Chef de service de Biochimie, Biologie moléculaire, et Toxicologie Environementale), Dr A.E. Hay de Bettignie (UFR de Lyon)

      - Comité de suivi : un coordinateur scientifique, un membre de la DRCI pour le CHUGA, un personnel de Floralis, un personnel de la DGDRIV
 

* Soutien financier : 

Cette plateforme a bénéficié d'une aide de l’État gérée par l'Agence Nationale de la Recherche au titre du programme « Investissements d'avenir» portant la référence ANR-15-IDEX-02.

* Demande de projet :