Thème : Des études multiomiques à haut débit sur le cancer ont permis de caractériser l'hétérogénéité inter-tumorale et ont contribué à l'élaboration de classifications moléculaires faisant consensus. Néanmoins, ces classifications négligent l'hétérogénéité intra-tumorale et ne reflètent que le sous-type le plus abondant dans l'échantillon examiné. Isoler une population cellulaire d'intérêt a partir d'échantillons cliniques hétérogènes n'est pas possible dans la pratique, c'est pourquoi il est essentiel de développer des outils bioinformatiques permettant d'étudier et d'estimer l'hétérogénéité

Looking for a postdoc aiming at applying phylogenomics approaches and dimensionality reduction methods to tackle the problem of the emergence and evolution of enzyme functions. Candidate’s profile: strong background in computational biology, evolutionary genomics or mathematical methods, with a strong interest to investigate evolution of biological functions.
Master 2 internship in Experimental Evolution proposed in the research team TIMC TrEE studying the evolutionary mechanisms involved in the adaptation of microorganisms to their environment, from in vitro culture to their eukaryotic hosts (including human hosts). One of the research topic deals with the Evolution of the structure and expression of (meta)-genomes, which aims at investigating the genomic determinants responsible for the remarkable adaptive properties of microorganisms (archaea and bacteria). Skills: Basic computational handling and analysis of metagenomic data, know-how to test for bacterial phenotypes.
Offre de thèse CIFRE proposée par le laboratoire TIMC - équipe TrEE, la société CONIDIA/CONIPHY et la Région Auvergne-Rhône-Alpes dans le cadre du Projet PHYTOFONG : " Nouveau test de détection des résistances des champignons phytopathogènes aux fongicides ". Profil: Titulaire d’un Master 2, Compétences techniques en microbiologie (mycologie) et microscopie. Contacts : Pr Muriel Cornet & Dr Sébastien Vacher.
" The modelling of chromosome replication and segregation in bacteria using polymer physics approches. ", 2 years and more, ANR 19-CE45-0013, beginning January 2022.