medepir : MEthylation DEconvoluation PIpeline in R - Archive ouverte HAL
Logiciel Année : 2025

medepir : MEthylation DEconvoluation PIpeline in R

Magali Richard
Translational Innovation in Medicine and Complexity / Recherche Translationnelle et Innovation en Médecine et Complexité - UMR 5525
Modèles et Algorithmes pour la Génomique
CV
Clémentine Decamps
Florian Privé
Michael Gb Blum
  • Fonction : Auteur
  • PersonId : 854172

Résumé

Package {medepir} (MEthylation DEconvoluation PIpeline in R) provides practical implementation of recommended guidelines for inference of cell-type proportions with confounders, based on non-negative matrix factorization of DNA methylation data.

Domaines

Bio-informatique [q-bio.QM]

Magali Richard  : Connectez-vous pour contacter le contributeur

https://hal.science/hal-04979641

Soumis le : jeudi 6 mars 2025-11:09:09

Dernière modification le : mercredi 12 mars 2025-03:05:01

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Dates et versions

hal-04979641 , version 1 (06-03-2025)

Identifiants

Métadonnées

  • version :
  • Licences : GNU Affero General Public License v3.0
  • Langage de programmation : R
  • Code Repository : https://github.com/bcm-uga/medepir

Citer

Exporter

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