Pneumocystis Infection Outbreaks in Organ Transplantation Units in France: A Nation-Wide Survey
Solène Le Gal
(1, 2)
,
Dominique Toubas
(3, 2)
,
Anne Totet
(4, 5)
,
Frédéric Dalle
(6, 7, 8)
,
Ahmed Abou Bacar
(9)
,
Yann Le Meur
(10)
,
Gilles Nevez
(1, 2)
,
Isabelle Accoceberry
(11)
,
Eric Bailly
(12)
,
Anne Pauline Bellanger
(13, 14)
,
Julie Bonhomme
(15, 16)
,
Estelle Cateau
(17, 18)
,
Ermanno Candolfi
(9)
,
Céline Damiani
(19, 5)
,
Eric Dannaoui
(20, 21)
,
Marie-Laure Dardé
(22, 23)
,
Anne Debourgogne
(24, 25)
,
Laurence Delhaes
(26, 27, 28, 29)
,
Guillaume Desoubeaux
(30)
,
Loïc Favennec
(31)
,
Pierre Flori
(32)
,
Frédéric Gabriel
(33)
,
Xavier Iriart
(33)
,
Laurence Lachaud
(34)
,
Marion Leterrier
(35)
,
Patrice Le Pape
(36)
,
Marie Machouard
,
Pierre Marty
(37)
,
Danièle Maubon
(38)
,
Laurence Millon
(14, 13)
,
Christelle Pomares
(39)
,
Denis Pons
(40)
,
Marie-Hélène Rodier
(41)
1
GEIHP -
Groupe d'Étude des Interactions Hôte-Pathogène
2 Laboratoire de Parasitologie et Mycologie [CHRU Brest]
3 MEDyC - Matrice Extracellulaire et Dynamique Cellulaire - UMR CNRS 7369
4 Laboratoire de parasitologie et de mycologie médicales [CHU Amiens]
5 AGIR - Agents infectieux, résistance et chimiothérapie - UR UPJV 4294
6 Laboratoire de parasitologie mycologie (CHU de Dijon)
7 PAM - Procédés Alimentaires et Microbiologiques [Dijon]
8 VAlMiS - Vin Aliment Microbiologie et Stress
9 IPPTS - Institut de Parasitologie et de Pathologie Tropicale de Strasbourg
10 CHU - BREST - Nephrologie - CHRU Brest - Service de Nephrologie
11 MFP - Microbiologie Fondamentale et Pathogénicité
12 CHRU Tours - Centre Hospitalier Régional Universitaire de Tours
13 Service de parasitologie et mycologie [CHRU de Besançon]
14 LCE - Laboratoire Chrono-environnement (UMR 6249)
15 ABTE - Aliments Bioprocédés Toxicologie Environnements
16 CHU Caen Normandie - CHU Caen Normandie – Centre Hospitalier Universitaire de Caen Normandie
17 MDE - Microbiologie de l'Eau [Équipe du laboratoire EBI Poitiers]
18 Service de mycologie et de parasitologie médicale [CHU de Poitiers]
19 PERITOX - Périnatalité et Risques Toxiques - UMR INERIS_I 1 UPJV
20 Unité de Parasitologie-Mycologie [CHU HEGP]
21 DYNAMIC - Dynamic Microbiology - EA 7380
22 UNILIM - Université de Limoges
23 CRBioLim - Centre de Ressources Biologiques Toxoplasma
24 CHRU Nancy - Centre Hospitalier Régional Universitaire de Nancy
25 SIMPA - Stress, Immunité, Pathogènes
26 UB - Université de Bordeaux
27 CRCTB - Centre de recherche Cardio-Thoracique de Bordeaux [Bordeaux]
28 CIC Bordeaux
29 FHU ACRONIM - Aquitaine’s Care and Research organisation for inflammatory and Immune-Mediated diseases [CHU Bordeaux]
30 CEPR - U 1100 - Centre d’Etude des Pathologies Respiratoires [Tours]
31 ESCAPE - Epidémiosurveillance de protozooses à transmission alimentaire et vectorielle
32 Anofel Cryptosporidium National Network
33 CHU Bordeaux - Centre Hospitalier Universitaire de Bordeaux
34 MIVEGEC - Maladies infectieuses et vecteurs : écologie, génétique, évolution et contrôle
35 Laboratoire de Microbiologie (CHD de la Roche-Sur-Yon)
36 IICiMed - Cibles et Médicaments des Infections et de l'Immunité - EA 1155
37 LHEEA - Laboratoire de recherche en Hydrodynamique, Énergétique et Environnement Atmosphérique
38 IAB - Institute for Advanced Biosciences / Institut pour l'Avancée des Biosciences (Grenoble)
39 C3M - Centre méditerranéen de médecine moléculaire
40 CHU Gabriel Montpied [Clermont-Ferrand]
41 EBI [Poitiers] - Écologie et biologie des interactions [UMR 7267]
2 Laboratoire de Parasitologie et Mycologie [CHRU Brest]
3 MEDyC - Matrice Extracellulaire et Dynamique Cellulaire - UMR CNRS 7369
4 Laboratoire de parasitologie et de mycologie médicales [CHU Amiens]
5 AGIR - Agents infectieux, résistance et chimiothérapie - UR UPJV 4294
6 Laboratoire de parasitologie mycologie (CHU de Dijon)
7 PAM - Procédés Alimentaires et Microbiologiques [Dijon]
8 VAlMiS - Vin Aliment Microbiologie et Stress
9 IPPTS - Institut de Parasitologie et de Pathologie Tropicale de Strasbourg
10 CHU - BREST - Nephrologie - CHRU Brest - Service de Nephrologie
11 MFP - Microbiologie Fondamentale et Pathogénicité
12 CHRU Tours - Centre Hospitalier Régional Universitaire de Tours
13 Service de parasitologie et mycologie [CHRU de Besançon]
14 LCE - Laboratoire Chrono-environnement (UMR 6249)
15 ABTE - Aliments Bioprocédés Toxicologie Environnements
16 CHU Caen Normandie - CHU Caen Normandie – Centre Hospitalier Universitaire de Caen Normandie
17 MDE - Microbiologie de l'Eau [Équipe du laboratoire EBI Poitiers]
18 Service de mycologie et de parasitologie médicale [CHU de Poitiers]
19 PERITOX - Périnatalité et Risques Toxiques - UMR INERIS_I 1 UPJV
20 Unité de Parasitologie-Mycologie [CHU HEGP]
21 DYNAMIC - Dynamic Microbiology - EA 7380
22 UNILIM - Université de Limoges
23 CRBioLim - Centre de Ressources Biologiques Toxoplasma
24 CHRU Nancy - Centre Hospitalier Régional Universitaire de Nancy
25 SIMPA - Stress, Immunité, Pathogènes
26 UB - Université de Bordeaux
27 CRCTB - Centre de recherche Cardio-Thoracique de Bordeaux [Bordeaux]
28 CIC Bordeaux
29 FHU ACRONIM - Aquitaine’s Care and Research organisation for inflammatory and Immune-Mediated diseases [CHU Bordeaux]
30 CEPR - U 1100 - Centre d’Etude des Pathologies Respiratoires [Tours]
31 ESCAPE - Epidémiosurveillance de protozooses à transmission alimentaire et vectorielle
32 Anofel Cryptosporidium National Network
33 CHU Bordeaux - Centre Hospitalier Universitaire de Bordeaux
34 MIVEGEC - Maladies infectieuses et vecteurs : écologie, génétique, évolution et contrôle
35 Laboratoire de Microbiologie (CHD de la Roche-Sur-Yon)
36 IICiMed - Cibles et Médicaments des Infections et de l'Immunité - EA 1155
37 LHEEA - Laboratoire de recherche en Hydrodynamique, Énergétique et Environnement Atmosphérique
38 IAB - Institute for Advanced Biosciences / Institut pour l'Avancée des Biosciences (Grenoble)
39 C3M - Centre méditerranéen de médecine moléculaire
40 CHU Gabriel Montpied [Clermont-Ferrand]
41 EBI [Poitiers] - Écologie et biologie des interactions [UMR 7267]
Solène Le Gal
- Fonction : Auteur
- PersonId : 947063
Anne Totet
- Fonction : Auteur
- PersonId : 890610
- IdHAL : totetanne
- ORCID : 0000-0002-9784-575X
- IdRef : 079379257
Frédéric Dalle
- Fonction : Auteur
- PersonId : 1561134
- IdHAL : frederic-dalle
- ORCID : 0000-0001-8849-7514
Gilles Nevez
- Fonction : Auteur
- PersonId : 890599
Estelle Cateau
- Fonction : Auteur
- PersonId : 743008
- IdHAL : estelle-cateau
- ORCID : 0000-0003-4424-7606
- IdRef : 117829757
Ermanno Candolfi
- Fonction : Auteur
- PersonId : 950673
- ORCID : 0000-0002-9491-510X
- IdRef : 069974659
Céline Damiani
- Fonction : Auteur
- PersonId : 1145690
- ORCID : 0000-0003-3532-6775
- IdRef : 139902953
Eric Dannaoui
- Fonction : Auteur
- PersonId : 756898
- IdHAL : eric-dannaoui
- ORCID : 0000-0002-2817-3830
- IdRef : 233666184
Marie-Laure Dardé
- Fonction : Auteur
- PersonId : 927601
Anne Debourgogne
- Fonction : Auteur
- PersonId : 762432
- IdHAL : anne-debourgogne
- ORCID : 0000-0002-1240-856X
- IdRef : 135395410
Guillaume Desoubeaux
- Fonction : Auteur
- PersonId : 953179
- ORCID : 0000-0001-7945-9890
- IdRef : 130306711
Xavier Iriart
- Fonction : Auteur
- PersonId : 994510
- ORCID : 0000-0002-0998-8962
Laurence Lachaud
- Fonction : Auteur
- PersonId : 1067267
- ORCID : 0000-0001-6761-8161
- IdRef : 060566663
Patrice Le Pape
- Fonction : Auteur
- PersonId : 1164862
- IdHAL : patrice-le-pape
- ORCID : 0000-0001-5059-6402
- IdRef : 066753430
Marie Machouard
- Fonction : Auteur
Pierre Marty
- Fonction : Auteur
- PersonId : 957141
Danièle Maubon
- Fonction : Auteur
- PersonId : 885808
- ORCID : 0000-0002-9080-7638
- IdRef : 103776761
Laurence Millon
- Fonction : Auteur
- PersonId : 760476
- IdHAL : laurence-millon
- ORCID : 0000-0001-5939-3409
- IdRef : 058504656
Marie-Hélène Rodier
- Fonction : Auteur
- PersonId : 1443422
- IdRef : 073277797
Résumé
The burden of nosocomial Pneumocystis infections in transplantation units in France was evaluated through a retrospective survey. Over 12 years, 16 outbreaks occurred, including 13 among renal transplant recipients (RTRs). We performed Pneumocystis jirovecii genotyping in 5 outbreaks, which suggested that specific strains may have been selected by RTRs.