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    Mots clés

    • Science des données
    • Biologie computationnelle 
    • Bioinformatique
    • Modélisation mathématique et physique
    • Données omiques
    • Biologie des systèmes
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    Accès publications HAL
    Article dans une revue Preventable deaths in a French regional trauma system: A six-year analysis of severe trauma mortality Edouard Girard, Q. Jegousso, B. Boussat, P. Francois, F.-X. Ageron, C. Letoublon, P. Bouzat
    Journal of Visceral Surgery, 2019, 156 (1), pp.10-16. ⟨10.1016/j.jviscsurg.2018.05.002⟩. ⟨hal-02064522⟩
    Article dans une revue pH as a potential therapeutic target to improve temozolomide antitumor efficacy : A mechanistic modeling study Angélique Stéphanou, Annabelle Ballesta
    Pharmacology Research & Perspectives, 2019, 7 (1), pp.e00454. ⟨10.1002/prp2.454⟩. ⟨hal-03015254⟩
    Chapitre d'ouvrage Modeling the Functional Coupling between 3D Chromatin Organization and Epigenome Cédric Vaillant, Daniel Jost
    Modeling the 3D conformation of genomes, 1, CRC Press, pp.21-56, 2019, 9781315144009. ⟨hal-02273692⟩
    Article dans une revue MatrixDB: integration of new data with a focus on glycosaminoglycan interactions Olivier Clerc, Madeline Deniaud, Sylvain Vallet, Alexandra Naba, Alain Rivet, Serge Pérez, Nicolas Thierry-Mieg, Sylvie Ricard-Blum
    Nucleic Acids Research, 2019, 47 (D1), pp.D376-D381. ⟨10.1093/nar/gky1035⟩. ⟨hal-02109904⟩
    Chapitre d'ouvrage Constructive Euler hydrodynamics for one-dimensional attractive particle systems C Bahadoran, Hervé Guiol, K. Ravishankar, E Saada
    Sidoravicius, V. (ed.). Sojourns in Probability Theory and Statistical Physics - III Interacting Particle Systems and Random Walks, A Festschrift for Charles M. Newman, Springer, Singapore, pp.43-89, 2019, Springer Proceedings in Mathematics & Statistics book series (PROMS, volume 300), 978-981-15-0302-3. ⟨hal-01447200v2⟩
    Article dans une revue Intraluminal Ultrasonic Palpation Imaging Technique Revisited for Anisotropic Characterization of Healthy and Atherosclerotic Coronary Arteries: A Feasibility Study Armida Gómez, Antoine Tacheau, Gerard Finet, Manuel Lagache, Jean-Louis Martiel, S. Lefloch, Saami K. Yazdani, Alex Elias-Zuñiga, Roderic I Pettigrew, Guy Cloutier, Jacques Ohayon
    Ultrasound in Medicine & Biology, 2019, 45 (1), pp.35-49. ⟨10.1016/j.ultrasmedbio.2018.08.020⟩. ⟨hal-01943969⟩
    Article dans une revue Using high-throughput sequencing for investigating intra-host hepatitis C evolution over long retrospective periods A. Caporossi, O. Kulkarni, M. Blum, V. Leroy, Patrice Morand, Sylvie Larrat, O. François
    Infection, Genetics and Evolution, 2019, 67, pp.136-144. ⟨10.1016/j.meegid.2018.11.004⟩. ⟨hal-01996548⟩
    Article dans une revue Quantitative phase imaging of adherent mammalian cells: a comparative study C. Allier, L. Hervé, O. Mandula, P. Blandin, Y. Usson, J. Savatier, S. Monneret, S. Morales
    Biomedical optics express, 2019, 10 (6), pp.2768. ⟨10.1364/BOE.10.002768⟩. ⟨hal-02181635⟩
    Chapitre d'ouvrage Set-Based Analysis for Biological Modeling Thao Dang, Tommaso Dreossi, Eric Fanchon, Oded Maler, Carla Piazza, Alexandre Rocca
    Automated Reasoning for Systems Biology and Medicine, 2019, 978-3-030-17296-1. ⟨hal-02273714⟩
    Article dans une revue Influence of Collaterals on True FFR Prediction for a Left Main Stenosis with Concomitant Lesions: An In Vitro Study Ricardo Coppel, Manuel Lagache, Gérard Finet, Gilles Rioufol, Armida Gómez, François Dérimay, Mauro Malvé, Saami K. Yazdani, Roderic Pettigrew, Jacques Ohayon
    Annals of Biomedical Engineering, 2019, 47 (6), pp.1409-1421. ⟨10.1007/s10439-019-02235-y⟩. ⟨hal-02062510⟩
    Article dans une revue Certified Roundoff Error Bounds using Bernstein Expansions and Sparse Krivine-Stengle Representations Victor Magron, Alexandre Rocca, Thao Dang
    IEEE Transactions on Computers, 2019, 68 (7), pp.953-966. ⟨10.1109/TC.2018.2851235⟩. ⟨hal-01956817⟩
    Article dans une revue Bi-allelic Mutations in ARMC2 Lead to Severe Astheno-Teratozoospermia Due to Sperm Flagellum Malformations in Humans and Mice C. Coutton, G. Martinez, Z.-E. Kherraf, A. Amiri-Yekta, M. Boguenet, A. Saut, X. He, F. Zhang, M. Cristou-Kent, J. Escoffier, M. Bidart, V. Satre, B. Conne, S. Fourati Ben Mustapha, L. Halouani, O. Marrakchi, M. Makni, H. Latrous, M. Kharouf, K. Pernet-Gallay, M. Bonhivers, S. Hennebicq, E. Dulioust, A. Touré, N. Rives, H. Gourabi, Y. Cao, R. Zouari, S. H. Hosseini, S. Nef, N. Thierry-Mieg, C. Arnoult, P. Ray
    American Journal of Human Genetics, 2019, 104 (2), pp.331-340. ⟨10.1016/j.ajhg.2018.12.013⟩. ⟨hal-02003335⟩
    Article dans une revue Encompassing new use cases - level 3.0 of the HUPO-PSI format for molecular interactions M. Sivade, D. Alonso-López, M. Ammari, G. Bradley, N. Campbell, A. Ceol, G. Cesareni, C. Combe, J. de Las Rivas, N. Del-Toro, J. Heimbach, H. Hermjakob, I. Jurisica, M. Koch, L. Licata, R. Lovering, J. Lynn, B. Meldal, G. Micklem, S. Panni, P. Porras, S. Ricard-Blum, B. Roechert, L. Salwinski, A. Shrivastava, J. Sullivan, Nicolas Thierry-Mieg, Y. Yehudi, K. van Roey, S. Orchard
    BMC Bioinformatics, 2018, 19 (1), ⟨10.1186/s12859-018-2118-1⟩. ⟨hal-01877988⟩
    Article dans une revue Are comorbidities associated with long-term survival of lung cancer? A population-based cohort study from French cancer registries A. Seigneurin, P. Delafosse, B. Tretarre, A.S. Woronoff, M. Velten, P. Grosclaude, A.V. Guizard, B. Lapôtre-Ledoux, S. Bara, F. Molinié, M. Colonna
    BMC Cancer, 2018, 18 (1), ⟨10.1186/s12885-018-5000-7⟩. ⟨hal-02272374⟩
    Article dans une revue CRELD1 is an evolutionarily-conserved maturational enhancer of ionotropic acetylcholine receptors Manuela d'Alessandro, Magali Richard, Christian Stigloher, Vincent Gache, Thomas Boulin, Janet Richmond, Jean-Louis Bessereau
    eLife, 2018, 7, ⟨10.7554/eLife.39649⟩. ⟨hal-02009626⟩
    Article dans une revue Consistent head up cardiopulmonary resuscitation haemodynamics are observed across porcine and human cadaver translational models J.C. Moore, Joe Holley, Nicolas Segal, M.C. Lick, Jose Labarere, R.J. Frascone, K.W. Dodd, A.E. Robinson, Charles Lick, Lauren Klein, Andrew Ashton, Angela Mcarthur, Adamantios Tsangaris, Anna Makaretz, Mike Makaretz, Guillaume Debaty, P.E. Pepe, K.G. Lurie
    Resuscitation, 2018, 132, pp.133-139. ⟨10.1016/j.resuscitation.2018.04.009⟩. ⟨hal-02070656⟩
    Article dans une revue Evaluation of ceftriaxone prescriptions in the emergency department of a university hospital: an urgent need for improvement and alternative therapy Stéphane Gennai, Stéphanie Ortiz, Bastien Boussat, Patrice François, Patricia Pavèse
    European Journal of Clinical Microbiology and Infectious Diseases, 2018, 37 (11), pp.2063-2068. ⟨10.1007/s10096-018-3339-y⟩. ⟨hal-02272346⟩
    Article dans une revue Incidence of prostate cancer and net survival by grade in a geriatric population: A population-based study in a French administrative entity from 1991 to 2013 Alexandre Bellier, Marc Colonna, Patricia Delafosse, Arnaud Seigneurin
    Cancer Epidemiology, 2018, 56, pp.60-66. ⟨10.1016/j.canep.2018.07.007⟩. ⟨hal-02272398⟩
    Article dans une revue VarExp: estimating variance explained by genome-wide GxE summary statistics Vincent Laville, A.R. Bentley, Florian Privé, Xiaofeng Zhu, Jim Gauderman, T.W. Winkler, Mike Province, D.C. Rao, H. Aschard
    Bioinformatics, 2018, 34 (19), pp.3412-3414. ⟨10.1093/bioinformatics/bty379⟩. ⟨hal-02272064⟩
    Article dans une revue Whole-exome sequencing identifies mutations in FSIP2 as a recurrent cause of multiple morphological abnormalities of the sperm flagella Guillaume Martinez, Zine-Eddine Kherraf, Raoudha Zouari, Selima Fourati Ben Mustapha, Antoine Saut, Karin Pernet-Gallay, Anne Bertrand, Marie Bidart, Jean Pascal Hograindleur, Amir Amiri-Yekta, Mahmoud Kharouf, Thomas Karaouzène, Nicolas Thierry-Mieg, Denis Dacheux-Deschamps, Véronique Satre, Melanie Bonhivers, Aminata Touré, Christophe Arnoult, Pierre Ray, Charles Coutton
    Human Reproduction, 2018, 33 (10), pp.1973 - 1984. ⟨10.1093/humrep/dey264⟩. ⟨hal-01877993⟩
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