THOMAS HINDRE

Enseignant-Chercheur (Université Grenoble Alpes)

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Coordonnées

Bâtiment : La Merci Jean Roget

Bureau : 510-F

Tél. : 0476143827
Thomas.Hindre@univ-grenoble-alpes.fr

Je suis maître de conférences à l’UFR Chimie/biologie de l’Université Grenoble Alpes et travaille au sein de l’équipe TrEE du laboratoire TIMC. En tant que bactériologiste moléculaire, je combine des approches omiques et biochimiques avec des expériences d’évolution pour comprendre les mécanismes qui sous-tendent l’adaptabilité des populations bactériennes. Je travaille en particulier à la caractérisation des lignées de l'Expérience d'Évolution à Long Terme (LTEE) dans laquelle 12 populations indépendantes de la bactérie Escherichia coli sont propagées en conditions de laboratoire depuis 1988. En parallèle, je développe des expériences d’évolution pour étudier la plasticité des réseaux de régulation de l’expression génique et la dynamique évolutive des intégrons de résistance chez la bactérie Escherichia coli. 

 

Disciplines scientifiques

Bactériologie, Évolution expérimentale, Régulation de l'expression génétique, Plasticité génomique

  • Responsable pédagogique de la Licence Sciences de la vie (Université Grenoble Alpes)
  • Responsable UE "Bacteriology" dans le Master "Molecular and Cellular Biology" (Université Grenoble Alpes)

Liste complète des publications

Publications sélectionnées

  • Insertion-sequence-mediated mutations both promote and constrain evolvability during a long-term experiment with bacteria. Consuegra, J., Gaffé, J., Lenski, R. E., Hindré, T., Barrick, J. E., Tenaillon, O., & Schneider, D. (2021). Nature communications, 12(1), 980. https://doi.org/10.1038/s41467-021-21210-7
  • Reducing the ionizing radiation background does not significantly affect the evolution of Escherichia coli populations over 500 generations. Lampe, N., Marin, P., Coulon, M., Micheau, P., Maigne, L., Sarramia, D., Piquemal, F., Incerti, S., Biron, D. G., Ghio, C., Sime-Ngando, T., Hindre, T., & Breton, V. (2019). Scientific reports, 9(1), 14891. https://doi.org/10.1038/s41598-019-51519-9
  • Bacterial genome architecture shapes global transcriptional regulation by DNA supercoiling.
    El Houdaigui, B., Forquet, R., Hindré, T., Schneider, D., Nasser, W., Reverchon, S., & Meyer, S. (2019). Nucleic acids research, 47(11), 5648–5657. https://doi.org/10.1093/nar/gkz300
  • Plasticity of Promoter-Core Sequences Allows Bacteria to Compensate for the Loss of a Key Global Regulatory Gene. Lamrabet, O., Plumbridge, J., Martin, M., Lenski, R. E., Schneider, D., & Hindré, T. (2019). Molecular biology and evolution, 36(6), 1121–1133. https://doi.org/10.1093/molbev/msz042
  • Epistasis and allele specificity in the emergence of a stable polymorphism in Escherichia coli. Plucain, J., Hindré, T., Le Gac, M., Tenaillon, O., Cruveiller, S., Médigue, C., Leiby, N., Harcombe, W. R., Marx, C. J., Lenski, R. E., & Schneider, D. (2014). Science (New York, N.Y.), 343(6177), 1366–1369. https://doi.org/10.1126/science.1248688
  • New insights into bacterial adaptation through in vivo and in silico experimental evolution. Hindré, T., Knibbe, C., Beslon, G., & Schneider, D. (2012). Nature reviews. Microbiology, 10(5), 352–365. https://doi.org/10.1038/nrmicro2750

Publié le 8 juillet 2026

Mis à jour le 8 juillet 2026