Audrey
Le Gouellec

Enseignant chercheur
Equipe TrEE
[info]
Tél : 04 76 63 75 58
Adresse : Bâtiment Jean Roget, Domaine de la Merci
Bureau : 813

Dr Audrey Le Gouellec est Maitre de Conférence des Universités et Praticien Hospitalier en biochimie médicale à la Faculté de Médecine de l'Université Grenoble Alpes (UGA) et au Centre Hospitalier Universitaire de Grenoble Alpes (CHUGA). Elle est la responsable scientifique de la plateforme de métabolomique par spectrométrie de masse GExiM. Recrutée depuis 2016, elle axe ses recherches au sein du laboratoire TIMC (UMR 5525 CNRS-UGA) sur l'étude de l'interaction hôte-pathogène et envisage à chaque fois des applications médicales. Au CHUGA, au sein du département de biochimie, biologie moléculaire et toxicologie environnementale, Audrey Le Gouellec est biologiste, responsable de 36 paramètres cliniques de soins biochimiques courants tels que l'inflammation et les marqueurs du LCR. Elle fait partie du conseil d'administration du "Réseau Francophone de Métabolomique et Fluxomique (RFMF)" et est directrice adjointe de l'école doctorale "Ingenierie pour la Santé la Cognition et l'Environnement". Elle a publié 31 articles évalués par des pairs (h-index : 13, num. de citations : 692, SIGAPS : 330 ).

Thèmes de recherche

Évolution et ingénierie du métabolisme

Dr Audrey Le Gouëllec étudie l'évolution des micro-organismes en lien avec son environnement et conçoit des microbes ingénierés intelligents par biologie de synthèse. Ses recherches visent à répondre à des problématiques de santé et se font en collaboration avec des cliniciens et des chercheurs.

Le métabolisme se définit comme l'ensemble des réactions chimiques nécessaires à une espèce pour survivre, se développer, se reproduire et interagir avec son milieu. La colonisation de niches écologiques extrêmement diverses par les microorganismes s’explique en particulier par la versatilité et les capacités d’adaptation de leurs métabolismes. Au laboratoire, nous étudions les évolutions métaboliques à différentes échelles de temps et d’espèces en combinant des approches expérimentales et bio-informatiques. Nous avons accès à la plateforme de spectrométrie de masse haute résolution « Grenoble Expertise in Metabolomics » (GExiM), dont les responsables scientifiques sont membres de l’équipe du laboratoire et de l’axe en particulier. Entre autres projets de recherche, nous étudions notamment l’évolution du métabolisme de souches de Pseudomonas aeruginosa chez des patients atteints de mucoviscidose sur plusieurs années en lien avec leur virulence, résistance aux antibiotiques et donc leur pathogénicté (Moyne et al. 2020) (Video YouTube du projet d'Oriane). Fort de ces connaissances, nous réalisons de l’ingénierie ciblée par biologie de synthèse pour obtenir des biomédicaments vivants recombinants (ou Live biotherapeutic product) que nous testons dans des modèles animaux de maladie inflammatoires ou des modèles infectieux (Par ex Thèse de Clément Caffaratti). 

 

 

Mots-clés
  • Biochimie
  • Metabolomique
  • Ingenierie métabolique
  • Biologie de synthèse
  • Microbiologie
Thèses encadrées
Clément Caffaratti : « Développement de biomédicaments vivants ingénierés au métabolisme contrôlé en vue d’une utilisation en tant que thérapie innovante dans le domaine de l'immunothérapie. »
Publications

Lien Google Scholar 

Recherche sur Pubmed

 

Principales publications depuis 5 ans :

21. Meynet, E., Laurin, D., Lenormand, J. L., Camara, B., Toussaint, B., & Le Gouellec, A. (2018). Killed but metabolically active Pseudomonas aeruginosa-based vaccine induces protective humoral- and cell-mediated immunity against Pseudomonasaeruginosa pulmonary infections. Vaccine, 36(14), 1893–1900. http://doi.org/10.1016/j.vaccine.2018.02.040 (SIGAPS C, IF 3,27) 

22. Cachat, J., Deffert, C., Alessandrini, M., Roux-Lombard, P., Le Gouellec, A., Stasia, M. J., … Krause, K. H. (2018). Altered Humoral Immune Responses and IgG Subtypes in NOX2-Deficient Mice and Patients: A Key Role for NOX2 in Antigen- Presenting Cells. Front Immunol, 9, 1555. http://doi.org/10.3389/fimmu.2018.01555 (SIGAPS C, IF 4,71)

23. Le Gouellec, A., Moyne, O., Meynet, E., Toussaint, B., & Fauvelle, F. (2018). HR-MAS NMR-based metabolomics reveals
metabolic changes in lung of mice infected with P. aeruginosa consistent with the degree of disease severity, and is a powerful evaluation tool for new treatment. J Proteome Res. http://doi.org/10.1021/acs.jproteome.8b00306 (SIGAPS B,
IF 3,78) 

24. Marlu, R., Malvezzi, P., Seyve, L., Jouve, T., Maurizi, J., Defendi, F., Le Gouellec, A. … Rostaing, L. (2018b). Effect of doublefiltration plasmapheresis for antibody-mediated rejection on hemostasis parameters and thrombin generation. Thromb Res, 166, 113–121. http://doi.org/10.1016/j.thromres.2018.04.018 (SIGAPS C, IF 3,26)

25. Marlu, R., Malvezzi, P., Seyve, L., Jouve, T., Maurizi, J., Defendi, F., Le Gouellec, A.… Rostaing, L. (2018a). Corrigendum to “Effect of double-filtration plasmapheresis for antibody-mediated rejection on hemostasis parameters and thrombin generation” [Thromb. Res. 166 (2018) 113-121]. Thromb Res, 171, 200. http://doi.org/10.1016/j.thromres.2018.05.033

26. Fuertes E., Carsin A.E., Garcia Larsen V., , Guerra S., Pin I., Leynaert B., Accordini S., Martinez-Moratalla J., M Anto J.,Urrutia I., Le Gouellec A., Heinrich J., Gislason T., Jõgi R., Janson C., Jarvis D., Garcia-Aymerich J., "Mediation analysis of
CRP on the association of physical activity with FEV1 and FVC: the ECRHS study." European Respiratory Journal 2018 52 : PA4483

27. Deloule V, Boisset C, Hannani D, Suau A, Le Gouellec A, Chroboczek J, Botté C, Yamaryo Y, Chirat C, “Prebiotic role of softwood hemicellulose in healthy mice model,” J. Funct. Foods, vol. 64, 2020. (SIGAPS NC)

28. Fuertes E, Carsin AE, Garcia-Larsen V, Guerra S, Pin I, Leynaert B, Accordini S, Martinez-Moratalla J, Antó JM, Urrutia I, LeGouellec A, Heinrich J, Gislason T, Jõgi R, Janson C, Jarvis D, Garcia-Aymerich J. The role of C-reactive protein levels on the association of physical activity with lung function in adults. PLoS One. 2019 Sep 23;14(9 (SIGAPS C, IF 2,74)

29. Jarmusch, Alan K., Mingxun Wang, Christine M. Aceves, Rohit S. Advani, Shaden Aguirre, Alexander A. Aksenov, GajenderAleti,…, Le Gouellec A,…, P. Dorrestein. “ReDU: A Framework to Find and Reanalyze Public Mass Spectrometry Data.” Nature Methods, 2020 August, 1–4. https://doi.org/10.1038/s41592-020-0916-7 (SIGAPS A, IF 30,82)

30. Nothias, Louis-Félix, Daniel Petras, Robin Schmid, Kai Dührkop, Johannes Rainer, Abinesh Sarvepalli, Ivan Protsyuk,…, Le Gouellec A,…, P. Dorrestein. “Feature-Based Molecular Networking in the GNPS Analysis Environment.” Nature Methods, 2020 August, 1–4. https://doi.org/10.1038/s41592-020-0933-6. (SIGAPS A, IF 30,82)

31. Méry G, Epaulard O, Borel AL, Toussaint B, Le Gouellec A. COVID-19: Underlying Adipokine Storm and Angiotensin 1-7 Umbrella. Front Immunol. 2020 Jul 21;11:1714. doi: 10.3389/fimmu.2020.01714. PMID: 32793244; PMCID: PMC7385229. (SIGAPS B, IF 5,085)

32. Moyne, O., Castelli, F., Bicout, D. J., Boccard, J., Camara, B., Cournoyer, B., … Le Gouëllec, A. (2021). Metabotypes of pseudomonas aeruginosa correlate with antibiotic resistance, virulence and clinical outcome in cystic fibrosis chronic infections. Metabolites, 11(2), 1–20. https://doi.org/10.3390/metabo11020063 (SIGAPS C, IF 4,097) 

Enseignements

1er cycle

  • 2011-2017 PACES1 Tutorat de Biochimie (6h/an)
  • 2014-2016 TD L2 Biotech (1h30/an)
  • 2014 TD L2 Biotech (2h/an)

2ème cycle
 

  • 2011-2012 DFGSM2: TP de Biochimie Médicale (50h) TP/TD
  • 2016-2021 DFGSM2 Module Biochimie de Inflammation CM Séance enseignement en présentiel interactif (SEPI) 2h/an
  • 2016-2021 DFGSM2 CM “Biotechnologie et médicaments innovants » (2h/an)
  • 2013-2021 DFGSM2 TD de Biochimie Médicale « Sémiobiologie de l’inflammation et biomarqueurs (6h/an)
  • 2014 DFGSM2 TD de Biochimie Médicale « Les enzymes » (4h/an)
  • 2014 DFGSM2 TD de Biochimie Médicale « La granulomatose sceptique » (2h/an)
  • 2018-2021 Master 2 Ingénierie de la Santé MITI UE transversale "Spectrométrie de masse et métabolomique" CM/TD (6h/an)
  • 2020-2021 Master 2 MRESTE CM « Analyse métabolomique » (2h/an)
  • 2020-2021 Master 2 MRESTE TD « Analyse métabolomique : Utilisation de MZmine et GNPS» (2h/an)
  • 2019-2021 Master 1 Ingénierie pour la Santé et le médicament APP Méthode d’étude et de production des cellules et de protéines à usage médical (4h/an)
  • 2014-2021 Master 1 Ingénierie pour la Santé et le médicament UE Maladie Transmissible (3h/an)
  • 2016-2021 Master 1 Ingénierie pour la Santé et le médicament « Biologie de synthèse » (2h/an)
  • 2014-2021 Master 2 Ingénierie pour la Santé et le médicament UR Lutte contre les agents infectieux (2h/an)
  • 2016- 2019 Master 2 « Biologie Cellulaire et Intégrative», CM « Bacteria for cancer immunotherapy » (2h/an)
  • 2016-2018 Master 2 Ingénierie pour la Santé et le médicament CM « Immunotherapie des cancers » (3h/an)
  • 2020-2021 Master 2 Ingénierie pour la Santé et le médicament “The contribution of Metabolomics for Translational Health research” (2h/an)

3ème cycle

  • 2016-2021 DES de Biologie Médicale Formation des internes de Biologie Médicale « Biochimie du LCR » 1h/ 2x/ an (2h/an)
  • 2021 DES De Biologie Medicale – Plateforme d’enseignement SIDES Cours enregistré sur la métabolomique (2h/an)
  • 2020-2021 Surveillance des EcNi (4h/an)
  • 2020 Accompagnement référent du service sanitaire (4h/an)
  • 2016-2021 Coach équipe iGEM (20h/an)
  • 2009-2021 Jury de stage de Master 2 et entretien de recrutement (160 heures environ) (30h/an)
  • 2021 DU Microbiote : Cours « Microbiote, comportement et santé mentale » ; « microbiote et métabolomique comme outils d’étude de la fonctionnalité » ; « Probiotiques ingénierés comme thérapie innovante » (3x 2h/an)