Biomarqueurs COVID-19
Étude pilote biomarqueurs CoVID-19.
Responsable(s) : Audrey Le Gouellec
Contrat : Fondation Université Grenoble Alpes - [2020-2022]
DEEPCROSS
Nouvelles solutions thérapeutiques en oncologie.
Responsable(s) : Jean-Luc Lenormand
Contrat : SATT Linksium - [2020-2021]
dEEPEN
Molecular and evolutionary principles governing enzyme regioselectivity.
Responsable(s) : Ivan Junier
Contrat : Agence Nationale de la Recherche (ANR-19-CE45-0013) - [2020-2024]
The exploitation of evolutionary information, and more particularly of residue coevolution, has revolutionized protein structure predictions. Adaptation of the methods issued from these analyses to the prediction and design of enzymatic functions remains an open problem. Enzymatic functions are indeed characterized by an internal dynamics of proteins that is difficult to model and study experimentally. In this project, we tackle this problem by studying in detail the capacity of certain hydroxylases of the flavin-containing monooxygenase (FMO) protein family to realize their reaction at different positions of the aromatic cycle of ubiquinone (UQ), a molecule key to the production of cellular energy. More precisely, UQ biosynthesis pathway involves three hydroxylation reactions occurring on three carbons of the UQ aromatic ring.
DIVIN
Dissémination et évolution des Intégrons de Résistance : effets du mode de vie en biofilm et du stress antibiotique.
Responsable(s) : Dominique Schneider
Contrat : Agence Nationale de la Recherche - [2020-2024]
EvoloWine
Évolution expérimentale en mileu extrême de la bactérie lactique Oenococcus oeni et applications à la sélection de levains malo-lactiques plus performants.
Responsable(s) : Dominique Schneider
Contrat : Agence Nationale de la Recherche - [2020-2024]
METAQUIN
Metagenomics investigation of quinone production in anoxic sea layers.
Responsable(s) : Sophie Abby
Contrat : IDEX Université Grenoble Alpes - Initiatives de recherche stratégiques (IRS) - [2020-2021]
MIMIC
Modélisation multi-échelles et intégration de données pour une Ingénierie du chromosome bactérien.
Responsable(s) : Ivan Junier
Contrat : CNRS 80|Prime (Projet de recherche inter-instituts multi-équipes) - [2020-2023]
Le projet MIMIC - Modélisation multi-échelles et intégration de données pour une Ingénierie du chromosome bactérien - vise à développer une plateforme de modélisation et d’intégration de données pour répondre à deux enjeux cruciaux de la biologie des systèmes et de synthèse : la rationalisation et l’ingénierie du chromosome bactérien.
MMAVAX
Vaccin contre Pseudomonas aeruginosa.
Responsable(s) : Audrey Legouellec
Contrat : SATT Linksium - [2020-2022]
M4Vax
Molecular Mechanisms of gut Microbiota and derived Metabolites governing differential Immune response to TLRL stimulation upon Vaccination.
Responsable(s) : Dalil Hannani
Contrat : IDEX Université Grenoble Alpes - [2019-]
O2-taboo
Hydroxylation indépendante d'O2 et synthèse anaérobie d'ubiquinone.
Responsable(s) : Fabien Pierrel
Contrat : Agence Nationale De La Recherche (ANR-19-CE44-0014) - [2019-2023]
En combinant des approches complémentaires, le projet O2-taboo adresse des questions de premier ordre en physiologie microbienne, en biochimie cellulaire et en biologie évolutive. Globalement, nos résultats permettront des avancées significatives en élucidant (i) la régulation et l’importance physiologique d’une nouvelle voie conservée chez les protéobactéries, (ii) la fonction moléculaire et l’organisation supramoléculaire des protéines UbiT,U,V, (iii) une nouvelle chimie pour des réactions d’hydroxylation indépendantes d’O2, (iv) la distribution et l’évolution des voies de biosynthèse d’UQ chez les protéobactéries.
GeWiEp
Interactions épistatiques à l’échelle du génome bactérien: étendue, émergence et bases moléculaires.
Responsable(s) : Dominique Schneider
Contrat : Agence Nationale de la Recherche (ANR-18-CE35-0005) - [2018-2023]
TULAMIBE
Évaluation des conditions et mécanismes de survie prolongée de Francisella tularensis dans l’environnement et contre-mesures.
Responsable(s) : Max Maurin
Contrat : Agence Nationale De La Recherche (ANR-17-ASTR-0024) - [2017-2021]
Le projet TULAMIBE a pour objectif principal de définir, en situation expérimentale et naturelle, les conditions et les mécanismes de survie prolongée de Francisella tularensis dans l’environnement hydro-tellurique. Cette bactérie, hautement infectieuse et virulente chez l’homme et de nombreux animaux, est responsable de la tularémie, zoonose présente dans l’hémisphère Nord. Cette affection a un impact majeur en santé publique et économique dans les pays de forte endémie.
ImmunoFiber
Responsable(s) : Dalil Hannani
Contrat : Ligue contre le Cancer - Comité Isère [2018-2021], IDEX IRS Université Grenoble Alpes [2018-2022], GEFLUC [2017-2022]
(An)aeroUbi
Caractérisation et importance physiologique de la biosynthèse d'ubiquinone sous différentes tensions d'oxygène.
Responsable(s) : Fabien Pierrel
Contrat : Agence Nationale De La Recherche (ANR-15-CE11-0001) - [2015-2021]
Pour produire leur énergie en absence de dioxygène (anaérobie), les bactéries utilisent la respiration anaérobie qui nécessite des quinones. En anaérobie, la fonction de l’ubiquinone (UQ) n’est pas connue. Sa voie de biosynthèse n’est pas caractérisée et implique des hydroxylases inconnues à ce jour. En étudiant la bactérie Escherichia coli, nous voulons élucider la voie de biosynthèse anaérobie de UQ, caractériser les protéines associées et comprendre les fonctions de UQ.
LIA PredEvo
Laboratoire de recherche international 'Prédire l'évolution'.
Responsable(s) : Dominique Schneider
Contrat : CNRS, Université Grenoble Alpes, Michigan State University - [2015-2023]
Programmes de recherche récents
Convention Université Antananarivo
Co-financement de thèse de Tahinamandrato Rasamoelina.
Responsable(s) : Muriel CORNET
Contrat : Convention Université d'Antananarivo (Madagascar) - Université Grenoble Alpes - [2016-2018]
SENSIFONG
Nouveau test de sensibilité aux antifongiques.
Responsable(s) : Delphine ALDEBERT ; Muriel CORNET
Contrat : SATT Linksium, Technology transfer and startup building Grenoble Alpes - Université Grenoble Alpes - [2016-2018]
TULASEQ
Accompagnement spécifique des travaux de recherches et d’innovation défense.
Responsable(s) : Max MAURIN
Contrat : Agence Nationale de la Recherche (ANR-15-ASTR-0021) - Université Grenoble Alpes - [2015-2019]
Séquençage haut débit (NGS) pour le développement de nouveaux marqueurs génotypiques chez Francisella tularensis : implications pour la surveillance épidémiologique de la tularémie en France et dans le domaine de la bio-défense.
FungiBET
Étude d'une nouvelle cible thérapeutique anti-fongique potentielle.
Responsable(s) : Muriel CORNET
Contrat : Agence Nationale de la Recherche (ANR-14-CE16-0027) - Université Grenoble Alpes - [2014-2018]
Étude d'une nouvelle cible thérapeutique anti-fongique potentielle : structure, fonction et inhibition des bromodomaines BET fongiques.
FINOVI
Responsable(s) : Jean-Luc LENORMAND
Contrat : Fondation FINOVI - Université Grenoble Alpes - [2015-2017]
CoEvo
Co-evolving units of genomes: Evolutionary insight into the functioning of organisms.
Responsable(s) : Ivan JUNIER
Contrat : Programme ATIP-AVENIR - CNRS - [2014-2019]
Sur la base d’une analyse statistique du contenu des génomes et de leur organisation chromosomique, CoEvo consiste à identifier des modules adaptatifs à la base du fonctionnement des bactéries. L’identification des modules est basée sur un cadre unifié d’analyse statistique, avec l’étude de trois échelles de co-évolution.