Soutenance de thèse d' Oriane Moyne le 29/03/19

 

Oriane Moyne des équipes TheREx et EPSP soutiendra sa thèse le vendredi 29 Mars 2019 à 10h :

« Approche métabolomique pour l'étude de l'évolution adaptative de Pseudomonas aeruginosa au cours des infections pulmonaires chroniques dans la mucoviscidose »

 

Lieu :  Amphithéâtre du Grenoble Institut des Neurosciences (GIN), La Tronche


Direction de thèse :
 

  • M. le Pr. Bertrand TOUSSAINT, PU-PH, Université Grenoble Alpes, CHU Grenoble-Alpes, Directeur de thèse
  • M. le Dr. Dominique J. BICOUT, Chercheur, Université Grenoble Alpes, VetAgroSup Lyon, Co-directeur de thèse
  • Mme le Dr. Audrey LE GOUELLEC, MCU-PH, Université Grenoble Alpes, CHU Grenoble-Alpes, Co-encadrante
  • M. le Pr. Max MAURIN, PU-PH, Université Grenoble Alpes, Laboratoire de Bactériologie, CHU Grenoble-Alpes, Co-encadrant, Invité


Jury de thèse :

  • M. le Pr. Christophe PISON, Professeur des Universités - Praticien Hospitalier (PU-PH), Clinique de Pneumologie, CHU Grenoble-Alpes, Président et Examinateur
  • Mme le Dr. Anne DOLEANS-JORDHEIM, Maître de Conférence Universitaire - Praticien Hospitalier (MCU-PH), Université Claude Bernard Lyon 1, Hospices Civils de Lyon, Rapporteure
  • M. le Pr. Thierry JOUENNE, Directeur de Recherche, UMR CNRS 6270, Université de Rouen, Rapporteur
  • M. le Dr. Julien BOCCARD, Chercheur, Université de Genève (Suisse), Examinateur
  • Mme le Dr. Florence CASTELLI, Ingénieur-Chercheur, CEA Paris-Saclay, Examinatrice

 

Capsule vidéo "Ma thèse au laboratoire TIMC" réalisée par Oriane Moyne pour la Journée Des Doctorants 2018.

 

Résumé de la thèse :

L’infection pulmonaire chronique à Pseudomonas aeruginosa (P. a.) est considérée comme la principale cause de morbidité et de mortalité liée à la mucoviscidose. Au cours de cette infection persistante, la bactérie s'adapte à l’environnement pulmonaire caractéristique de ces patients et évolue avec son hôte pendant des décennies. Cette évolution adaptative est portée par les phénotypes, avec notamment une diminution de la virulence et une augmentation de la résistance aux antibiotiques au cours du temps. Bien que plusieurs études aient tenté d’évaluer les mécanismes génétiques de cette évolution, il demeure aujourd’hui difficile d’expliquer les relations entre les mutations accumulées dans le génome bactérien et l’expression de phénotypes cliniquement pertinents, ou encore de corréler ces mutations avec l’état de santé du patient.

Nous proposons dans ce travail d’étudier les mécanismes sous-tendant cette évolution adaptative à un niveau d’observation post-génomique : la métabolomique. Dernière-née des disciplines –omiques, la métabolomique permet la prise de vue instantanée du métabolisme, et offre une vision au plus proche du phénotype. Pour cela, nous avons constitué une banque de lignées clonales évolutives de P. a. prélevées au cours de l’infection pulmonaire chronique chez des patients atteints de mucoviscidose. Cette banque a ensuite été caractérisée aux plans clinique, phénotypique et métabolomique. L’intégration de ces différents niveaux d’information par des méthodes statistiques multi-tableaux nous a permis de mettre en évidence des voies métaboliques impliquées dans la patho-adaptation de P. a. à son hôte.

Nos résultats permettent de faire émerger de nouvelles hypothèses pour le développement d’outils thérapeutiques et diagnostiques visant à améliorer la prise en charge de ces infections particulièrement résistantes aux antibiotiques. De plus, nos travaux démontrent l’intérêt de la métabolomique pour l’étude de l’évolution adaptative bactérienne en conditions naturelles.

 

Mots-clés :

Pseudomonas aeruginosa, évolution adaptative, métabolomique, analyses multi-tableaux, mucoviscidose.