Résistances Bactériennes aux Anti-Microbiens

Francisella tularensis, bactérie à Gram négatif, intracellulaire facultative, agent potentiel de menace biologique, est responsable de la tularémie. Cette zoonose est transmise à l’homme via un large réservoir animal ou par des vecteurs arthropodes. L’environnement hydrotellurique est également une source importante d’infections. Les mécanismes de survie de cette bactérie dans le milieu naturel restent mal connus mais incluent notamment la formation de biofilms et des interactions avec des protozoaires comme les amibes. La bactérie peut aussi entrer dans un état viable mais non cultivable (VBNC) qui favorise sa survie prolongée en milieu aquatique naturel et en laboratoire. Le projet vise à étudier la formation, la réversion, la virulence et la détection de ces formes VBNC.

Financement : ANR-23-ASM2-0005 TULADETECT

Collaborations : 

TIMC, TrEE, Max Maurin

CEA de Grenoble, IRIG, Thierry Livache

CEA de Marcoule, Li2D, Laurent Bellanger

Société Aryballe (devenue Olfaktion), Sami Slimani

Publications : 

Hennebique A, Peyroux J, Brunet C, Martin A, Henry T, Knezevic M, Santic M, Boisset S, Maurin M. Amoebae can promote the survival of Francisella species in the aquatic environment. Emerg Microbes Infect. 2021, 10(1):277-290. doi: 10.1080/22221751.2021.1885999. 

Brunet CD, Hennebique A, Peyroux J, Pelloux I, Caspar Y, Maurin M. Presence of Francisella tularensis subsp. holarctica DNA in the Aquatic Environment in France. Microorganisms. 2021, 28;9(7):1398. doi:10.3390/microorganisms9071398.

Dans un contexte One Health, un des projets concerne les réservoirs hospitaliers, humains et environnementaux, d’Entérobactéries productrices de carbapénèmases, les EPC. Au CHU de Grenoble, en réanimation adulte et pédiatrique, des souches bactériennes ont été isolées de patients, de syphons des chambres de patients et des eaux usées. Les cultures et les tests génomiques montrent que les souches cliniques et environnementales constituent des réservoirs d’EPC, qui partagent avec les souches cliniques, des gènes de résistance aux antibiotiques et leurs supports génétiques. Le projet consiste à identifier les gènes de résistances, leurs modalités de transmission, et à évaluer l’effet des désinfectants sur la dynamique de ces résistances.

Financement : TIMC Emergence, Asposan

Collaboration : CHU Grenoble Alpes

Publication : 

Hennebique A, Monge-Ruiz J, Roger-Margueritat M, Morand P, Terreaux-Masson C, Maurin M, Mercier C, Landelle C, Buelow E. The hospital sink drain biofilm resistome is independent of the corresponding microbiota, the environment and disinfection measures. Water Res. 2025 Sep 15;284:123902. doi: 10.1016/j.watres.2025.123902. 

Des résultats récents ont montré que des doses sub-inhibitrices de ceftazidime ou de colistine, antibiotiques majeurs dans le traitement des infections par Acinetobacter baumannii, conduisent à la formation de biofilms. Le projet vise à quantifier le phénomène d’hétérorésistance dans les populations par analyse démographique profilée, caractériser les différents constituants des biofilms et caractériser l’émergence de ces résistances par des approches multi-omiques.

Financement : SPARC (India)

Collaboration : A.S. Kharat, Jawaharlal Nehru Univ., New Dehli, India

Publications : 

Makwana N, Karad DD, Dheeraj, Yadav B, Saini C, Mercier C, Kharat AS. (2026) Global strategies to fight carbapenem-resistant Acinetobacter baumannii (CRAB) infections. Review. Microb Pathog. 214:108412. doi: 10.1016/j.micpath.2026.108412.

Yadav B, Karad DD, Kharat KR, Makwana N, Jaiswal A, Chawla R, Mani M, Boro HH, Joshi PR, Kamble DP, Mercier C, Kharat AS. (2025) Environmental and clinical impacts of antibiotics' sub-minimum inhibitory concentrations on the development of resistance in Acinetobacter baumannii. Review. Sci Total Environ. 979:179521. doi: 10.1016/j.scitotenv.2025.179521.

Yadav B, Jaiswal A, Kumar D, Karad DD, Joshi PR, Kamble DP, Mercier C, Kharat AS. (2024) Sub-minimum inhibitory concentrations in ceftazidime exacerbate the formation of Acinetobacter baumannii biofilms. Microb Pathog. doi: 10.1016/j.micpath.2024.107229.

Kharat AS, Makwana N, Nasser M, Gayen S, Yadav B, Kumar D, Veeraraghavan B, Mercier C. (2024) Dramatic increase in antimicrobial resistance in ESKAPE clinical isolates over the 2010-2020 decade in India. Review. Int J Antimicrob Agents. 63(5):107125. doi: 10.1016/j.ijantimicag.2024.107125.

Valeria BELLINI (vbellinichu-grenoble-alpes.fr (vbellini[at]chu-grenoble-alpes[dot]fr))

Elena BUELOW (elena.buelowgmail.com (elena[dot]buelow[at]gmail[dot]com))

Aurélie HENNEBIQUE

Max MAURIN (mmaurinchu-grenoble-alpes.fr (mmaurin[at]chu-grenoble-alpes[dot]fr))

Corinne MERCIER (corinne.mercieruniv-grenoble-alpes.fr (corinne[dot]mercier[at]univ-grenoble-alpes[dot]fr))

A.S. Kharat, Jawaharlal Nehru Univ., New Dehli, India

CEA de Grenoble, IRIG, Thierry Livache

CEA de Marcoule, Li2D, Laurent Bellanger

CHU Grenoble Alpes

Société Aryballe (devenue Olfaktion), Sami Slimani